PuTTY は (BSDライクな) MIT のライセンスで使用できます。
「PuTTY は Win32 プラットフォーム用の Telnet および SSH の フリーな実装であり、基本的にイギリス在住の Simon Tatham によって 書かれ、メンテナンスされています」
「TTSSH はフリーの Windows 用 SSH クライアントです。 これは Tera Term Pro の拡張 DLL として実装されています。 Tera Term Pro は非常によくできたフリーの Windows用 端末エミュレータ / telnet クライアントであり、そのソースも利用できます。TTSSH は Tera Term Pro の本来ある機能をまったく損うことなく、SSH の 機能を追加します。TTSSH もまたフリーでダウンロードでき、 そのソースもオープンソースライセンスで使えます。さらに TTSSH は 全部オーストラリアで開発されています (中略)。」
別のバージョンである UTF-8 TeraTerm Pro with TTSSH2 も利用可能です。
Cygwin を使えば Windows 上で OpenSSH (SSH1 および SSH2 プロトコル) が 走ります。移植版 OpenSSH を使っています。 これはソースからビルドするか、 Cygwin のネイティブパッケージとしてインストールすることができます。
WinSCP は Windows 上で動く sftp(1) および scp(1) プログラムです。 ここで使っている SSH プロトコルのコアは PyTTY をベースにしています。
FileZilla は Windows 9x, ME, NT4, 2000 および XP 上で動く高機能の FTP クライアントです。 これは簡単に使えることと、なるべく多くの機能をサポートすることを目指して 設計されており、それでいて高速かつ安定に動作します。これは SFTP をサポートしています。